Perbedaan Utama: Windows Mobile 6.5 pada awalnya diperkenalkan sebagai pembaruan sementara untuk sistem operasi Windows Mobile 6.1. Pembaruan ini dimaksudkan untuk mengurangi kesenjangan antara OS 6.1 dan OS 7, membuatnya lebih mudah untuk beralih dari sistem yang lebih lama ke yang lebih baru. Windows Phone 7 bukanlah upgrade Windows Mobile 6.5; itu adalah sistem operasi yang benar-benar dirubah dan baru. Windows Phone 7 dibangun di atas kernel yang berbeda dari Windows Mobile dan tidak kompatibel ke belakang. Windows Phone 7 adalah langkah maju dari sistem operasi Windows Mobile 6.5. Selain mengubah tampilan OS, perusahaan juga menambahkan dan menghapus banyak fitur dari versi yang lebih lama.
Windows Mobile 6.5 awalnya diperkenalkan sebagai pembaruan sementara untuk sistem operasi Windows Mobile 6.1. Pembaruan ini dimaksudkan untuk mengurangi kesenjangan antara OS 6.1 dan OS 7, membuatnya lebih mudah untuk beralih dari sistem yang lebih lama ke yang lebih baru. Pembaruan tidak pernah menjadi bagian dari rencana Microsoft dan dianggap sebagai pembaruan kecil untuk sistem yang lebih lama sampai perusahaan meluncurkan OS Windows Phone 7 baru pada tahun 2010. Pembaruan diumumkan pada Mobile World Congress 2009 dan telepon pertama yang menjalankan sistem ini adalah diluncurkan pada Oktober 2009. Perusahaan juga menyediakan tiga pembaruan kecil untuk sistem, 6.5.1, 6.5.3 dan 6.5.5, yang dibuat untuk membantu transisi pelanggan dari Windows Mobile ke Windows Phone baru. Sistem operasi 6.5 datang dengan antarmuka pengguna yang diperbarui yang mirip dengan yang ditawarkan pada pemutar Zune Microsoft. UI menawarkan layar Today baru dan label yang dapat digulir secara vertikal bernama "Titanium". Perusahaan juga menyediakan browser Internet Explorer 6 baru. Selain OS baru, perusahaan juga mengumumkan beberapa layanan komputasi awan baru seperti: SkyBox, SkyLine, SkyMarket. SkyMarket serupa dengan Android Market dan menawarkan aplikasi yang dapat diunduh untuk pengguna.
Windows Phone 7 adalah langkah maju dari sistem operasi Windows Mobile 6.5. Selain mengubah tampilan OS, perusahaan juga menambahkan dan menghapus banyak fitur dari versi yang lebih lama. Windows Mobile 6.5 sangat dapat dikustomisasi, dengan banyak perusahaan memasukkan UI mereka sendiri pada OS dan sepenuhnya mengubah tampilan OS. Ini dihilangkan dalam Windows Phone 7, dengan perusahaan menuntut serangkaian persyaratan dari produsen. GSMArena menyatakan persyaratan ini sebagai: Ukuran Layar Kapasitif WVGA, mampu setidaknya empat titik sentuh, prosesor 1GHz dengan Akselerasi GPU, RAM 256 MB, Penyimpanan Flash 8 GB, Kamera 5 MP dengan LED Flash, A-GPS, Kompas, Akselerometer, Cahaya Sekitar, Sensor Jarak dan Tiga kunci perangkat keras: Mulai, Cari dan Kembali.
Perusahaan juga tidak mengizinkan perubahan langsung ke OS, mengharuskan Live Tiles tetap terlihat di layar Mulai. Aplikasi dan perangkat lunak lain di Windows Mobile 6.5 diatur dalam Tab, sedangkan pada Windows Phone 7 ditampilkan di Live Tiles. Windows Mobile 6.5 mengharuskan pengguna untuk mengklik tombol Menu untuk melihat semua aplikasi yang tersedia pada perangkat, sedangkan pada Windows Phone 7 menggesek ke kanan pada layar Mulai memungkinkan pengguna untuk melihat semua aplikasi dalam daftar alfabet. Di Windows Mobile 6.5, tab aplikasi dapat digeser di layar Menu, memungkinkan pengguna untuk menempatkan aplikasi sesuai dengan penggunaan. Namun, pada Windows Phone 7 pengguna dapat menyematkan aplikasi ke ubin Live. Windows Mobile 6.5 juga menawarkan kemampuan multitask, memungkinkan pengguna mengunduh Task Manager yang dapat digunakan pengguna untuk pengalihan aplikasi. Di Windows Phone 7, ini tidak tersedia sampai pembaruan yang lebih baru memungkinkan pengguna untuk menahan tombol kembali yang menunjukkan tangkapan layar dari lima aplikasi akses terakhir. Perbedaan utama lainnya adalah bahwa Windows Mobile App Store, App store di Windows Phone 7 lebih rapi dan menawarkan lebih banyak aplikasi dibandingkan dengan yang ada di Windows Mobile 6.5. Satu kesalahan yang merupakan masalah berulang pada Windows Mobile 6.5 adalah bahwa ponsel dan aplikasi akan hang dan tidak memuat, mengharuskan pengguna untuk mengatur ulang ponsel secara konstan. Ini dihilangkan di Windows Phone 7.
Windows Mobile 6.5 dianggap sebagai pilihan yang lebih baik bagi banyak orang, khususnya banyak pengembang karena memungkinkan mereka untuk mengubah dan memodifikasi OS. Namun, banyak pengguna juga senang dengan tampilan baru dan tata letak Windows Phone 7 yang lebih ketat.